基因測序技術(shù)是一種基因檢測技術(shù)，也被稱為DNA測序技術(shù)，是進行分子生物學研究和基因改造的基礎(chǔ)，也是解鎖人類生命奧秘的重要方式之一?；驕y序技術(shù)發(fā)展了40余年，已在眾多領(lǐng)域被廣泛應用，包括生物的基因組圖譜繪制、物種進化演替過程、表觀遺傳學、疾病相關(guān)基因的確定和診斷等等。

近年來，基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)由實驗室研究演變到臨床使用，為我們理解人類生物學特征和疾病，評估遺傳疾病提供了關(guān)鍵性信息，所以說基因測序技術(shù)是下一個改變世界的技術(shù)毫不為過。

在新冠疫情期間，這項技術(shù)得到了更多人的關(guān)注。疫情爆發(fā)初期，在不到一個月的時間內(nèi)，通過基因測序技術(shù)，新冠病毒(COVID-19)的基因組序列被公布，為分析武漢新型冠狀病毒的進化來源、致病機制提供了第一手資料。不少國家也發(fā)起了COVID-19患者基因測序計劃，以了解個人基因?qū)Σ《靖腥痉磻挠绊?，這項研究的數(shù)據(jù)將為患者護理及藥物處方提供信息，未來還可以幫助疫苗設(shè)計，從而拯救更多生命。

整個測序環(huán)節(jié)中，從樣品收集到上機測序，水貫穿了包括測序儀的日常清洗維護和試劑配制在內(nèi)的每一個環(huán)節(jié)。作為一個必不可少的基礎(chǔ)試劑，水的品質(zhì)對最終測序結(jié)果會產(chǎn)生顯著影響。水中的雜質(zhì)，如無機鹽、有機物、核酸酶、顆粒物等，不僅會污染設(shè)備，縮短測序儀毛細管的使用壽命，而且還會降低DNA聚合酶的活性，最終干擾測序結(jié)果的準確性。

下面這些基因測序經(jīng)常遇到的問題很有可能是使用的水有問題，快來看看你有沒有中招…

Q1：DNA測序樣品用什么溶劑溶解比較好?

溶解DNA測序樣品，使用超溶解更好。

原因： DNA的測序反應的原理其實就是Taq酶的聚合反應，需要一個合適的酶反應條件。如果溶解DNA樣品的溶液含有過多的鹽，會影響測序反應體系，造成Taq酶的聚合性能下降，干擾測序反應甚至無法產(chǎn)生信號。

純水應用Tips: 超采用基因測序?qū)Ｓ贸兓茖W配方填料的低鎂型純化柱，可以特異性去除水中的鎂離子，降低空白本底對測序反應體系的影響。

Q2：測序結(jié)果怎么沒有峰圖呢?

原因：模板被降解，罪魁禍首可能是測序使用的水中含有核酸酶。

純水應用Tips: 制備的需要帶有終端濾器，如滲源SYZ系列純水機帶有終端微濾，可以去除DNA酶和RNA酶。

Q3：為什么測序峰圖出現(xiàn)了“瀑布效應”?

“瀑布效應”是基線突然從高處下降的現(xiàn)象。

原因：樣品被有機物污染，有機物會被激發(fā)產(chǎn)生熒光，抬高基線。

純水應用Tips: 使用帶有TOC檢測系統(tǒng)的超純水機,如滲源SYZ-V、SYZ-VF系列純水機，有機物含量低于10 ppb，采用全氧化法設(shè)計的TOC在線監(jiān)測系統(tǒng)，在線監(jiān)測TOC含量，符合ISPE制藥工程指南 / 美國藥典USP等標準對于TOC檢測的要求。

Q4：“釘子峰”如何避免?

“釘子峰”是A、T、C、G四個顏色的峰都被突然拔起，形成的尖銳峰形。

原因： 溶液中可能存在氣泡或者顆粒，氣泡和顆粒對激光全反射，形成“釘子峰”。

純水應用Tips: 純水機取水口配備0.22μm的終端濾器，測序之前使用超聲波對超純水進行脫氣可以有效地防止“釘子峰”。